9 Сезон
После битвы с Думсдеем прошло около месяца. Кал-Эл начинает обучение в Крепости Одиночества. Ему удается восстановить систему, и он начинает тренировки. Решив изменить свою жизнь, Кларк создает себе «костюм» — черную футболку, на груди которой мелом нарисован знак дома Элов, который используется как символ. Теперь везде, где бы Красно-Синее Пятно не геройствовало, остается знак «S». В криминальных кругах Метрополиса обеспокоены новоявленным супергероем, хотя им стало легче после того как Зеленая Стрела и его банда отошли от дел. Внезапно появляется Лоис, не помнящая события последних недель. А в замке Люторов молодой Зод, майор войск Криптона, сталкивается с проблемами в своем отряде.
Хлоя решает воссоздать команду Зеленой стрелы, после того как Кларк отказывается изменить прошлое — спасти Джимми Ольсена и убить Думсдея. В редакции «Daily Planet» появляется новый сотрудник, чье мнение о Красно-Синем пятне резко негативное. Вскоре выясняется, что Красно-Синего пятна больше нет — только Пятно, в котором с трудом узнается знак S. Оливер Куинн сжигает костюм Зеленой Стрелы и отходит от геройства. Он пытается вернуть Лоис, но безрезультатно. Куинн встречает больную СПИДом девушку Мию, которая позже станет его ученицей Спиди.
Майор Зод пытается выяснить, что пошло не так во время высадки на Землю. Среди криптонцев оказывается Джор-Эл, который уже «бывал» на Земле полвека назад. Поднимая архивы, криптонцы узнают символ дома Элов. Решив, что Джор-Эл предал экспедиционный корпус Зод решает покарать предателя. С целью обнаружения Пятна Зод выпускает вирус, справиться с которым можно только с помощью крови криптонца. Пытаясь вернуть себе силы, кандорианцы взламывают системы ЛюторКорп, крадут прототипы и используют свою передовую науку, чтобы объединить их в Металло — киборга, созданного в попытке воссоздать Брейниака. Истово веря, что Пятно — это Джор-Эл, Зод решает во чтобы то ни стало заполучить такие же силы — неуязвимость, суперскорость, суперсилу, суперзрение и слух.
Джор-Эл приходит на ферму Кентов, где встречает Хлою. Выясняется, что кандорианцы, вышедшие из сферы — часть генетических экспериментов Криптона. Материалы для клонирования были взяты за двадцать лет до уничтожения Криптона — когда была уничтожена столица Кандор. Становится известной еще одна шокирующая деталь — Джор-Эл и Зод были лучшими друзьями. Их дружба дала трещину, когда Джор-Эл отказался воскресить семью Зода в рамках экспериментов с клонированием. И тогда генерал решил использовать для этих целей Думсдея. Джор-Эл потрясен рассказом Хлои об «уничтожении» Криптона Зодом и тем, что у него есть сын. Тесс похищает Джор-Эла и убеждает его выдать себя за Пятно, чтобы защитить Кларка. Тем не менее, Зоду удается раскусить обман. Джор-Эл умирает на руках у Кларка. Теперь Зод знает, кто такой Пятно и собирается использовать его, чтобы получить силу желтого солнца.
Лоис впадает в кому. Тесс похищает Лоис, чтобы узнать будущее, но ей мешает Кларк, который случайно соединяет свое сознание с сознанием Лоис. Он видит будущее, в котором он выступил против Зода и проиграл. Зод сделал солнце красным, вместе со своими солдатами получив суперсилы и лишив их Кларка. Зод был побежден, но погибли Хлоя и Оливер, Кларк был смертельно ранен. Лоис надевает кольцо Легиона, чтобы изменить прошлое.
Кларк решает исполнить последнюю просьбу отца и спасти Зода от его темной стороны. Он приходит в его убежище, и Зод приказывает всем кандорианцам опуститься на колени перед Кал-Элом.
